Sesongen 2012/2013 har Trønder-Lyn 3 samarbeidslag med våre naboklubber. Dette er:

- G14 Trønder-Lyn/Melhus/Gimse som administreres av Trønder-Lyn.
- J 12 Hovin/Trønder-LynLundamo/Flå som administreres av Hovin.
- D 4 Trønder-Lyn/Hovin som administreres av Trønder-Lyn.